Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDO1Q16878 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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