Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
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PTPROQ16827 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPROQ16827 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPROQ16827 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPROQ16827 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPROQ16827 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPROQ16827 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPROQ16827 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPROQ16827 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPROQ16827 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPROQ16827 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPROQ16827 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPROQ16827 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPROQ16827 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPROQ16827 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPROQ16827 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PTPROQ16827 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
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PTPROQ16827 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPROQ16827 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPROQ16827 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPROQ16827 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPROQ16827 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPROQ16827 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPROQ16827 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPROQ16827 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPROQ16827 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPROQ16827 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
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PTPROQ16827 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPROQ16827 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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PTPROQ16827 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPROQ16827 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPROQ16827 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPROQ16827 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPROQ16827 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
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PTPROQ16827 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPROQ16827 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPROQ16827 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPROQ16827 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPROQ16827 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPROQ16827 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPROQ16827 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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PTPROQ16827 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPROQ16827 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPROQ16827 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPROQ16827 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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PTPROQ16827 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PTPROQ16827 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
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PTPROQ16827 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPROQ16827 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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PTPROQ16827 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPROQ16827 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPROQ16827 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPROQ16827 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPROQ16827 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
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PTPROQ16827 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPROQ16827 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
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PTPROQ16827 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPROQ16827 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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PTPROQ16827 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPROQ16827 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPROQ16827 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
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PTPROQ16827 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPROQ16827 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPROQ16827 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPROQ16827 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPROQ16827 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPROQ16827 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPROQ16827 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPROQ16827 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPROQ16827 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PTPROQ16827 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PTPROQ16827 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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