Protein–RNA interactions for Protein: Q16778

HIST2H2BE, Histone H2B type 2-E, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2BEQ16778 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
HIST2H2BEQ16778 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms