Protein–RNA interactions for Protein: Q16134

ETFDH, Electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFDHQ16134 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETFDHQ16134 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETFDHQ16134 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETFDHQ16134 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETFDHQ16134 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETFDHQ16134 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETFDHQ16134 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETFDHQ16134 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETFDHQ16134 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETFDHQ16134 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETFDHQ16134 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETFDHQ16134 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETFDHQ16134 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETFDHQ16134 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ETFDHQ16134 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ETFDHQ16134 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ETFDHQ16134 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ETFDHQ16134 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ETFDHQ16134 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ETFDHQ16134 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ETFDHQ16134 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ETFDHQ16134 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ETFDHQ16134 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ETFDHQ16134 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ETFDHQ16134 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ETFDHQ16134 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ETFDHQ16134 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ETFDHQ16134 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms