Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
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SCN9AQ15858 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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SCN9AQ15858 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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SCN9AQ15858 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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SCN9AQ15858 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SCN9AQ15858 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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