Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
VAMP3Q15836 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms