Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HMGN3Q15651 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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