Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRIP13Q15645 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms