Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TLR1Q15399 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms