Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKX1-1Q15270 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKX1-1Q15270 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
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