Protein–RNA interactions for Protein: Q15119

PDK2, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK2Q15119 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PDK2Q15119 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PDK2Q15119 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PDK2Q15119 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDK2Q15119 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDK2Q15119 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PDK2Q15119 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDK2Q15119 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDK2Q15119 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDK2Q15119 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDK2Q15119 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PDK2Q15119 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms