Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PDCD1Q15116 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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