Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB3GAP1Q15042 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
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