Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HERPUD1Q15011 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
HERPUD1Q15011 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HERPUD1Q15011 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HERPUD1Q15011 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HERPUD1Q15011 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HERPUD1Q15011 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HERPUD1Q15011 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
HERPUD1Q15011 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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HERPUD1Q15011 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
HERPUD1Q15011 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
HERPUD1Q15011 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.02■□□□□ -0
HERPUD1Q15011 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
HERPUD1Q15011 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HERPUD1Q15011 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HERPUD1Q15011 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HERPUD1Q15011 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
HERPUD1Q15011 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HERPUD1Q15011 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HERPUD1Q15011 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
HERPUD1Q15011 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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HERPUD1Q15011 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERPUD1Q15011 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERPUD1Q15011 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERPUD1Q15011 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERPUD1Q15011 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HERPUD1Q15011 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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HERPUD1Q15011 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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HERPUD1Q15011 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HERPUD1Q15011 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HERPUD1Q15011 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HERPUD1Q15011 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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HERPUD1Q15011 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HERPUD1Q15011 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HERPUD1Q15011 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HERPUD1Q15011 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HERPUD1Q15011 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
HERPUD1Q15011 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HERPUD1Q15011 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HERPUD1Q15011 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HERPUD1Q15011 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HERPUD1Q15011 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HERPUD1Q15011 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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HERPUD1Q15011 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
HERPUD1Q15011 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HERPUD1Q15011 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HERPUD1Q15011 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
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