Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NFIXQ14938 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
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