Protein–RNA interactions for Protein: Q14590

ZNF235, Zinc finger protein 235, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF235Q14590 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF235Q14590 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF235Q14590 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF235Q14590 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF235Q14590 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF235Q14590 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF235Q14590 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF235Q14590 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF235Q14590 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF235Q14590 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF235Q14590 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF235Q14590 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF235Q14590 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF235Q14590 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF235Q14590 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
ZNF235Q14590 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ZNF235Q14590 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ZNF235Q14590 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
ZNF235Q14590 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF235Q14590 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF235Q14590 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF235Q14590 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF235Q14590 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF235Q14590 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF235Q14590 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF235Q14590 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF235Q14590 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF235Q14590 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF235Q14590 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF235Q14590 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF235Q14590 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF235Q14590 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF235Q14590 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF235Q14590 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF235Q14590 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF235Q14590 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF235Q14590 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF235Q14590 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF235Q14590 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF235Q14590 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF235Q14590 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF235Q14590 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF235Q14590 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF235Q14590 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF235Q14590 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF235Q14590 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF235Q14590 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF235Q14590 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF235Q14590 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF235Q14590 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF235Q14590 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF235Q14590 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF235Q14590 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF235Q14590 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF235Q14590 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF235Q14590 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ZNF235Q14590 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF235Q14590 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF235Q14590 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF235Q14590 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF235Q14590 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF235Q14590 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF235Q14590 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF235Q14590 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF235Q14590 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF235Q14590 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF235Q14590 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF235Q14590 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF235Q14590 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF235Q14590 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF235Q14590 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
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ZNF235Q14590 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF235Q14590 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF235Q14590 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF235Q14590 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF235Q14590 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF235Q14590 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF235Q14590 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF235Q14590 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF235Q14590 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF235Q14590 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF235Q14590 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF235Q14590 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF235Q14590 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF235Q14590 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF235Q14590 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF235Q14590 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF235Q14590 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF235Q14590 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF235Q14590 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF235Q14590 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF235Q14590 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF235Q14590 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF235Q14590 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF235Q14590 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ZNF235Q14590 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF235Q14590 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF235Q14590 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ZNF235Q14590 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
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