Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
FAM53BQ14153 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM53BQ14153 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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