Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF9Q13886 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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