Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SPTAN1Q13813 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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