Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CUL3Q13618 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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