Protein–RNA interactions for Protein: Q13319

CDK5R2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R2Q13319 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CDK5R2Q13319 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms