Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATMQ13315 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATMQ13315 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATMQ13315 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATMQ13315 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATMQ13315 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATMQ13315 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATMQ13315 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATMQ13315 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATMQ13315 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATMQ13315 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATMQ13315 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATMQ13315 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATMQ13315 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATMQ13315 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATMQ13315 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATMQ13315 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATMQ13315 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATMQ13315 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATMQ13315 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATMQ13315 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATMQ13315 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATMQ13315 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATMQ13315 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATMQ13315 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATMQ13315 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATMQ13315 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATMQ13315 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATMQ13315 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATMQ13315 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATMQ13315 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATMQ13315 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATMQ13315 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATMQ13315 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATMQ13315 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATMQ13315 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATMQ13315 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ATMQ13315 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATMQ13315 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATMQ13315 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATMQ13315 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATMQ13315 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATMQ13315 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATMQ13315 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATMQ13315 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATMQ13315 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATMQ13315 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATMQ13315 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATMQ13315 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATMQ13315 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATMQ13315 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATMQ13315 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATMQ13315 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATMQ13315 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATMQ13315 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATMQ13315 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATMQ13315 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATMQ13315 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATMQ13315 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATMQ13315 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATMQ13315 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATMQ13315 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATMQ13315 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATMQ13315 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATMQ13315 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATMQ13315 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATMQ13315 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATMQ13315 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATMQ13315 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATMQ13315 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATMQ13315 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATMQ13315 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATMQ13315 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ATMQ13315 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATMQ13315 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATMQ13315 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATMQ13315 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATMQ13315 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ATMQ13315 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATMQ13315 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATMQ13315 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATMQ13315 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATMQ13315 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATMQ13315 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATMQ13315 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATMQ13315 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATMQ13315 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ATMQ13315 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATMQ13315 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATMQ13315 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATMQ13315 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATMQ13315 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATMQ13315 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATMQ13315 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATMQ13315 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATMQ13315 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATMQ13315 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATMQ13315 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATMQ13315 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ATMQ13315 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
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