Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SRSF6Q13247 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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