Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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ERCC8Q13216 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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ERCC8Q13216 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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ERCC8Q13216 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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ERCC8Q13216 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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ERCC8Q13216 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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ERCC8Q13216 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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ERCC8Q13216 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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ERCC8Q13216 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ERCC8Q13216 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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