Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ACACAQ13085 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms