Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
BNIP1Q12981 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNIP1Q12981 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
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