Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
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PTPN13Q12923 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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PTPN13Q12923 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PTPN13Q12923 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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PTPN13Q12923 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
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PTPN13Q12923 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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PTPN13Q12923 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PTPN13Q12923 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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