Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BPTFQ12830 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms