Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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RAB40BQ12829 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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RAB40BQ12829 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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RAB40BQ12829 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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RAB40BQ12829 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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RAB40BQ12829 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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RAB40BQ12829 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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RAB40BQ12829 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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RAB40BQ12829 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB40BQ12829 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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