Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

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Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TWF1Q12792 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
TWF1Q12792 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
TWF1Q12792 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TWF1Q12792 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TWF1Q12792 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TWF1Q12792 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TWF1Q12792 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TWF1Q12792 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TWF1Q12792 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TWF1Q12792 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TWF1Q12792 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TWF1Q12792 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TWF1Q12792 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TWF1Q12792 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TWF1Q12792 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TWF1Q12792 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TWF1Q12792 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TWF1Q12792 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TWF1Q12792 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TWF1Q12792 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TWF1Q12792 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TWF1Q12792 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TWF1Q12792 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TWF1Q12792 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TWF1Q12792 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TWF1Q12792 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TWF1Q12792 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TWF1Q12792 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TWF1Q12792 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TWF1Q12792 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TWF1Q12792 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TWF1Q12792 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TWF1Q12792 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TWF1Q12792 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TWF1Q12792 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TWF1Q12792 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TWF1Q12792 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TWF1Q12792 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TWF1Q12792 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TWF1Q12792 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TWF1Q12792 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TWF1Q12792 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TWF1Q12792 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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TWF1Q12792 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TWF1Q12792 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TWF1Q12792 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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TWF1Q12792 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TWF1Q12792 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TWF1Q12792 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TWF1Q12792 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TWF1Q12792 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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TWF1Q12792 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TWF1Q12792 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TWF1Q12792 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TWF1Q12792 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TWF1Q12792 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TWF1Q12792 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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TWF1Q12792 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TWF1Q12792 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TWF1Q12792 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TWF1Q12792 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TWF1Q12792 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TWF1Q12792 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TWF1Q12792 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
TWF1Q12792 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TWF1Q12792 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TWF1Q12792 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TWF1Q12792 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TWF1Q12792 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TWF1Q12792 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TWF1Q12792 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TWF1Q12792 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TWF1Q12792 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TWF1Q12792 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TWF1Q12792 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TWF1Q12792 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TWF1Q12792 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TWF1Q12792 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TWF1Q12792 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TWF1Q12792 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TWF1Q12792 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TWF1Q12792 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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