Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FAM27E3Q08E93 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms