Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC3A1Q07837 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms