Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FMODQ06828 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FMODQ06828 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FMODQ06828 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FMODQ06828 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FMODQ06828 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FMODQ06828 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FMODQ06828 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FMODQ06828 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FMODQ06828 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FMODQ06828 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FMODQ06828 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FMODQ06828 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FMODQ06828 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FMODQ06828 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FMODQ06828 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FMODQ06828 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FMODQ06828 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FMODQ06828 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FMODQ06828 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FMODQ06828 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FMODQ06828 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FMODQ06828 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FMODQ06828 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FMODQ06828 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FMODQ06828 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FMODQ06828 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FMODQ06828 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FMODQ06828 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FMODQ06828 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FMODQ06828 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FMODQ06828 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FMODQ06828 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FMODQ06828 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FMODQ06828 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FMODQ06828 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FMODQ06828 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FMODQ06828 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FMODQ06828 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FMODQ06828 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FMODQ06828 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FMODQ06828 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FMODQ06828 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FMODQ06828 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FMODQ06828 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FMODQ06828 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FMODQ06828 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FMODQ06828 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FMODQ06828 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FMODQ06828 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FMODQ06828 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FMODQ06828 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FMODQ06828 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FMODQ06828 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FMODQ06828 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FMODQ06828 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FMODQ06828 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FMODQ06828 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FMODQ06828 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FMODQ06828 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FMODQ06828 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FMODQ06828 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FMODQ06828 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FMODQ06828 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FMODQ06828 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FMODQ06828 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FMODQ06828 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FMODQ06828 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FMODQ06828 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FMODQ06828 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FMODQ06828 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FMODQ06828 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FMODQ06828 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FMODQ06828 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FMODQ06828 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FMODQ06828 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FMODQ06828 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FMODQ06828 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FMODQ06828 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FMODQ06828 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FMODQ06828 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FMODQ06828 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FMODQ06828 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FMODQ06828 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FMODQ06828 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FMODQ06828 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FMODQ06828 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FMODQ06828 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FMODQ06828 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FMODQ06828 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FMODQ06828 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FMODQ06828 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FMODQ06828 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FMODQ06828 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FMODQ06828 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FMODQ06828 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FMODQ06828 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FMODQ06828 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FMODQ06828 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FMODQ06828 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms