Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PSME1Q06323 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PSME1Q06323 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms