Protein–RNA interactions for Protein: Q05215

EGR4, Early growth response protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR4Q05215 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EGR4Q05215 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms