Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EMX2Q04743 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms