Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF8Q02556 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms