Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPIBQ01892 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms