Protein–RNA interactions for Protein: Q00888

PSG4, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 4, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG4Q00888 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSG4Q00888 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PSG4Q00888 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms