Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDK5Q00535 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDK5Q00535 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms