Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PITPNAQ00169 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PITPNAQ00169 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms