Protein–RNA interactions for Protein: P61081

UBE2M, NEDD8-conjugating enzyme Ubc12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2MP61081 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2MP61081 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2MP61081 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2MP61081 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2MP61081 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2MP61081 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2MP61081 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2MP61081 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2MP61081 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2MP61081 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2MP61081 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.06■□□□□ 0
UBE2MP61081 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2MP61081 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.06■□□□□ 0
UBE2MP61081 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2MP61081 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2MP61081 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2MP61081 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2MP61081 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2MP61081 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2MP61081 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2MP61081 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2MP61081 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2MP61081 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2MP61081 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2MP61081 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.06■□□□□ 0
UBE2MP61081 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.06■□□□□ 0
UBE2MP61081 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2MP61081 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2MP61081 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2MP61081 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2MP61081 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2MP61081 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2MP61081 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2MP61081 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2MP61081 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2MP61081 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2MP61081 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2MP61081 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2MP61081 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2MP61081 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2MP61081 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
UBE2MP61081 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
UBE2MP61081 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UBE2MP61081 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.05■□□□□ 0
UBE2MP61081 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UBE2MP61081 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
UBE2MP61081 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UBE2MP61081 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ 0
UBE2MP61081 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UBE2MP61081 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
UBE2MP61081 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
UBE2MP61081 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UBE2MP61081 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UBE2MP61081 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UBE2MP61081 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UBE2MP61081 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
UBE2MP61081 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
UBE2MP61081 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2MP61081 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2MP61081 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2MP61081 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.05■□□□□ -0
UBE2MP61081 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2MP61081 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2MP61081 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2MP61081 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2MP61081 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC15.05■□□□□ -0
UBE2MP61081 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.05■□□□□ -0
UBE2MP61081 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2MP61081 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2MP61081 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2MP61081 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2MP61081 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.05■□□□□ -0
UBE2MP61081 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2MP61081 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2MP61081 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2MP61081 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2MP61081 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2MP61081 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2MP61081 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2MP61081 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2MP61081 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2MP61081 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2MP61081 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2MP61081 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2MP61081 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2MP61081 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2MP61081 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2MP61081 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2MP61081 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.04■□□□□ -0
UBE2MP61081 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2MP61081 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2MP61081 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2MP61081 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2MP61081 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2MP61081 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2MP61081 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2MP61081 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2MP61081 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2MP61081 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2MP61081 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms