Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BACE1P56817 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BACE1P56817 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BACE1P56817 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BACE1P56817 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BACE1P56817 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BACE1P56817 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BACE1P56817 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BACE1P56817 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BACE1P56817 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BACE1P56817 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BACE1P56817 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BACE1P56817 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BACE1P56817 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
BACE1P56817 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BACE1P56817 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BACE1P56817 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BACE1P56817 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BACE1P56817 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BACE1P56817 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
BACE1P56817 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BACE1P56817 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BACE1P56817 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BACE1P56817 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BACE1P56817 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BACE1P56817 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BACE1P56817 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BACE1P56817 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
BACE1P56817 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BACE1P56817 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BACE1P56817 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
BACE1P56817 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BACE1P56817 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BACE1P56817 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BACE1P56817 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BACE1P56817 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BACE1P56817 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BACE1P56817 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BACE1P56817 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BACE1P56817 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BACE1P56817 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BACE1P56817 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BACE1P56817 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BACE1P56817 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BACE1P56817 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BACE1P56817 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BACE1P56817 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BACE1P56817 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BACE1P56817 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BACE1P56817 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BACE1P56817 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BACE1P56817 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BACE1P56817 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BACE1P56817 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BACE1P56817 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BACE1P56817 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BACE1P56817 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
BACE1P56817 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
BACE1P56817 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
BACE1P56817 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BACE1P56817 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
BACE1P56817 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
BACE1P56817 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BACE1P56817 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BACE1P56817 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
BACE1P56817 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BACE1P56817 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BACE1P56817 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BACE1P56817 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BACE1P56817 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BACE1P56817 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BACE1P56817 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BACE1P56817 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BACE1P56817 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BACE1P56817 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
BACE1P56817 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BACE1P56817 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
BACE1P56817 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
BACE1P56817 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BACE1P56817 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BACE1P56817 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BACE1P56817 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BACE1P56817 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BACE1P56817 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BACE1P56817 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BACE1P56817 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BACE1P56817 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BACE1P56817 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BACE1P56817 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BACE1P56817 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BACE1P56817 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BACE1P56817 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BACE1P56817 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BACE1P56817 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BACE1P56817 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
BACE1P56817 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BACE1P56817 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BACE1P56817 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BACE1P56817 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BACE1P56817 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms