Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CASP9P55211 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CASP9P55211 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CASP9P55211 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CASP9P55211 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CASP9P55211 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CASP9P55211 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
CASP9P55211 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CASP9P55211 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CASP9P55211 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CASP9P55211 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CASP9P55211 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CASP9P55211 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CASP9P55211 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CASP9P55211 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CASP9P55211 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CASP9P55211 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CASP9P55211 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CASP9P55211 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CASP9P55211 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CASP9P55211 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CASP9P55211 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CASP9P55211 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CASP9P55211 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CASP9P55211 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
CASP9P55211 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
CASP9P55211 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CASP9P55211 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CASP9P55211 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
CASP9P55211 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASP9P55211 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASP9P55211 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASP9P55211 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASP9P55211 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASP9P55211 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASP9P55211 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASP9P55211 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASP9P55211 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASP9P55211 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASP9P55211 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CASP9P55211 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CASP9P55211 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASP9P55211 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASP9P55211 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASP9P55211 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASP9P55211 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASP9P55211 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASP9P55211 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
CASP9P55211 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASP9P55211 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASP9P55211 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASP9P55211 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASP9P55211 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASP9P55211 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASP9P55211 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASP9P55211 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASP9P55211 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASP9P55211 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASP9P55211 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASP9P55211 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASP9P55211 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
CASP9P55211 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP9P55211 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP9P55211 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP9P55211 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP9P55211 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP9P55211 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP9P55211 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP9P55211 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP9P55211 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP9P55211 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP9P55211 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP9P55211 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP9P55211 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP9P55211 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP9P55211 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP9P55211 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP9P55211 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP9P55211 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP9P55211 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP9P55211 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP9P55211 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP9P55211 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP9P55211 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP9P55211 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP9P55211 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP9P55211 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP9P55211 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP9P55211 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP9P55211 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP9P55211 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP9P55211 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP9P55211 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP9P55211 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP9P55211 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CASP9P55211 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP9P55211 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP9P55211 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP9P55211 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CASP9P55211 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms