Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms