Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARFIP2P53365 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARFIP2P53365 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ARFIP2P53365 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARFIP2P53365 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARFIP2P53365 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARFIP2P53365 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARFIP2P53365 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARFIP2P53365 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARFIP2P53365 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARFIP2P53365 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARFIP2P53365 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARFIP2P53365 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARFIP2P53365 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARFIP2P53365 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARFIP2P53365 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARFIP2P53365 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARFIP2P53365 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARFIP2P53365 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARFIP2P53365 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARFIP2P53365 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARFIP2P53365 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARFIP2P53365 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARFIP2P53365 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARFIP2P53365 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ARFIP2P53365 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARFIP2P53365 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARFIP2P53365 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARFIP2P53365 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARFIP2P53365 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARFIP2P53365 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARFIP2P53365 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARFIP2P53365 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARFIP2P53365 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARFIP2P53365 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARFIP2P53365 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARFIP2P53365 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARFIP2P53365 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARFIP2P53365 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARFIP2P53365 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARFIP2P53365 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARFIP2P53365 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARFIP2P53365 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARFIP2P53365 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARFIP2P53365 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARFIP2P53365 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARFIP2P53365 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARFIP2P53365 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARFIP2P53365 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARFIP2P53365 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARFIP2P53365 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARFIP2P53365 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ARFIP2P53365 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ARFIP2P53365 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ARFIP2P53365 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ARFIP2P53365 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ARFIP2P53365 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ARFIP2P53365 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ARFIP2P53365 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ARFIP2P53365 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms