Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GRIA4P48058 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GRIA4P48058 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms