Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACADSBP45954 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms