Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms