Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA4P35212 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA4P35212 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA4P35212 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA4P35212 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA4P35212 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA4P35212 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA4P35212 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA4P35212 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA4P35212 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA4P35212 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA4P35212 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA4P35212 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA4P35212 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA4P35212 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA4P35212 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA4P35212 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GJA4P35212 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GJA4P35212 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GJA4P35212 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GJA4P35212 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GJA4P35212 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
GJA4P35212 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GJA4P35212 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GJA4P35212 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GJA4P35212 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GJA4P35212 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA4P35212 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA4P35212 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA4P35212 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA4P35212 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA4P35212 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA4P35212 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA4P35212 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA4P35212 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA4P35212 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA4P35212 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA4P35212 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA4P35212 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA4P35212 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA4P35212 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA4P35212 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA4P35212 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA4P35212 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA4P35212 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA4P35212 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA4P35212 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA4P35212 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA4P35212 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA4P35212 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA4P35212 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA4P35212 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA4P35212 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA4P35212 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA4P35212 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA4P35212 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA4P35212 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA4P35212 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GJA4P35212 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJA4P35212 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJA4P35212 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJA4P35212 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GJA4P35212 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
GJA4P35212 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJA4P35212 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJA4P35212 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJA4P35212 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJA4P35212 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GJA4P35212 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
GJA4P35212 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJA4P35212 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJA4P35212 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GJA4P35212 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJA4P35212 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GJA4P35212 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJA4P35212 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJA4P35212 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GJA4P35212 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GJA4P35212 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GJA4P35212 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GJA4P35212 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GJA4P35212 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GJA4P35212 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GJA4P35212 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GJA4P35212 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GJA4P35212 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GJA4P35212 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GJA4P35212 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJA4P35212 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJA4P35212 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GJA4P35212 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJA4P35212 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJA4P35212 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJA4P35212 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GJA4P35212 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GJA4P35212 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GJA4P35212 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA4P35212 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA4P35212 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GJA4P35212 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms